抗战期间，戴笠领导军统，抗击日军，暗杀汉奸，获取情报，为抗战胜利做出了一定的贡献。这是他黑暗一生中的几点火花。

    谍海大战

    1937年7月中旬，戴笠亲赴上海布置对日工作和潜伏组织。到上海后，他先把王兆槐找来交代了任务。

    “我这次奉校长之命来找杜月笙。请他出面，把上海民众组织起来，协助国军御敌。你要设法把日本三菱银行和三井洋行仓库里的大批武器搞到手。”戴对王说。

    “沈醉他们已经从日租界撤出来了。战事一发，日本人就开始清查他们的租界，怕混入我们派去的特工人员！”王沮丧地说。

    “我们的情报工作做得太迟了……”戴笠摇摇头，随即命王陪他去见杜。杜很快答应了戴的要求。当晚，王兆槐、沈醉前往日本的武器仓库，把枪偷了出来。在一个多月的时间内，成立了1万多人的“苏浙别动队”。

    1937年8月13日，淞沪抗战开始，戴笠即于当天亲率特务处的高级干部余乐醒、谢力公、潘其武、毛人凤和大批特务骨干急赴上海，指挥上海的特工力量配合中国军队对日作战。成立了军委会参谋本部战地调查勘测组，展开对日的谍报工作。并指挥别动队和上海市警察总队。到11月，蒋下达上海撤退的命令。在这之前，戴已开始着手准备上海沦陷后的潜伏组织。他命周伟龙负责上海地区的行动工作，他的江山同乡姜绍谟负责情报工作。另外，戴还利用杜的帮会组织在上海布置了一些工商业界人士与无业流氓，分别开展宣传造谣与破坏日方经济等活动。

    11月9日，上海沦陷。戴笠下令配属各部队的战地调查组必须坚持到最后，没有他的命令不准撤离。戴在最后时刻，仍然首先将撤离事宜安排检查完毕，然后才搭乘上海至香港的最后一班船离去。

    戴到达香港后，立即召集特务处香港站的特务开会，指出东南沿海大城市沦陷后，香港的战略地位随之提高。戴决定成立香港区，加强谍报工作。戴在香港布置完工作后，回到南昌，继续布置沦陷区的特工力量。

    戴笠7月中旬刚到上海，蒋介石在南京紧急将他召回。让他参与侦破一起最高军事机密泄露案。原来在8月初，蒋主持召开最高国防会议，决定“制敌机先”，在日军发动上海战役前，先行歼灭在上海的日本海军陆战队，拦截长江上的日本军舰与商船。但是这个命令还未下达到军队，日军舰船和这一带的侨民几乎在一夜之间，狼狈撤往江阴以下江面。在这同时，当蒋决定出席中央军校“总理纪念周”对学生进行训话时，发现居然有日特事先得到消息企图混入。蒋介石闻讯大怒，要求有关方面迅速侦破。

    戴笠认为，只要能够把与会或接触到这两件机密情报的人员进行调查，不难发现蛛丝马迹。经过一番严密的过滤，很快发现行政院机要秘书黄浚有重大嫌疑。此人是福州人，早年在日本留学，其子亦经日本留学被分配在外交部工作。黄浚生活腐化、挥霍无度，经济来源可疑，且他是与会人之一。戴笠派人密切监视跟踪他。结果在黄浚与日本特务又一次交接情报时被当场拿获，其子也因参与活动被逮捕。蒋下令将黄以卖国罪枪决。这是戴在抗战初期与日谍的第一次较量。

    淞沪战争期间，戴还亲自指挥了一场高水平的对日间谍大战。
1937年9月中旬，救国会“七君子”之一章乃器向戴推荐了两名上海大学毕业的高材生程克祥、彭寿，并说他们愿意为反间谍斗争做出贡献。程、彭二人在东亚同文书院工作，这是一个以日本陆军为后台的日谍巢穴。戴经过考虑，决定按程、彭二人的要求成立“文友社”，并谨防反间之计，设计逼程、彭二人就范。

    文有社成立后，戴笠首先将特务处的特工人员不露任何痕迹地打进去，以控制这座反间谍机关的主动权。其次遏制企图进入文友社的日方间谍，并把程克祥介绍来的3名日方间谍赶走。最后，把程、彭争取过来，真正建立了一个反日谍机关。

    正在这时，日军统帅部急调原在华北的间谍老手南本实隆少将秘密潜赴上海，以窃取中国统帅部对日作战的部署。南本在华北、内蒙、东北等地，曾多次破坏戴笠布置的特工组织，戴对其恨之入骨。

    南本到上海后，直接用重金收买日本士官学校的同学，国民党原八十七师参谋长杨振华，要其提供中国军队的情报。杨将这一情况告诉了戴。戴命令文强顶替杨，以军事委员会少将高级参谋的身份与南本接触。

    经过文强与南本的多次会谈，戴笠布置了天罗地网，准备收拾南本，不料恰在此时，上海沦陷，杨振华叛变。戴的计划落空了。但这次智斗日谍的整体设计，表现了戴的特工才能。

    刺杀汪精卫

    1938年12月18日，汪精卫乘机离开重庆，经昆明，到达河内。12月29日在香港《南华日报》上发表臭名昭著的《艳电》，以“恢复和平”为口号，开始卖国投敌的活动。

    汪精卫的出逃，令蒋非常震怒。他命令戴笠即赴香港，设法威胁汪精卫在香港的追随者，并秘密监视汪逆一行，防止他们公开投敌。戴到香港后，决定来个声东击西、杀一儆百。他亲自打电话给汪的追随者《华南日报》负责人林柏生和写文章拥护汪精卫“和平”主张的香港中央通讯社社长肖同兹，指责他们不该发表文章，与重庆政府唱对台戏，并派人扬言说，要烧掉《华南日报》。但并未起作用，戴又派人在他们回家的路上，用铁棍将他们打伤，以示警告。

    不久，戴亲自把陈恭澍、王鲁翘送到河内，监视汪，并等候命令。河内的监视工作取得了突破，获取了汪准备公开叛国投敌的证据，戴笠得到消息后，立即密令陈等人做好行动准备，又分别派人从国内运去枪支弹药等武器，自己亲自把证据呈送蒋介石。蒋命戴除掉汪，戴立刻通知河内方面开始行动。

    戴在此前曾以何永年的化名来到河内，亲自布置了行动计划。他拜访了国民政府驻河内总领事许念曾，以封官许愿作条件，要求他鼎力相助。并与他派驻河内的直属通信员徐先生联系，通过他疏通与河内高层和警方的关系。

    3月中旬，戴获悉汪要离开河内，命令行动组立即行动。3月20日晚，陈强闯汪宅，直奔汪的卧室，见到一个男人正在往床下钻，以为此人是汪，便冲其腰部连开三枪。事后，他们才知道打死的是汪的秘书曾仲鸣。戴笠得到报告后，很生气，遭到蒋的一通大骂。

    从1939年5月到1940年1月，戴笠为刺杀汪精卫，又连续四次组织行动，不但投入了很大精力和物力，而且连损4员大将，仍然寸功未建。

    成立“黑室”破译日电

    1943年正式成立了中美特种技术合作所，戴任所长。这无疑使军统的特务活动进入了一个新阶段，也把戴笠的权力和地位推向顶峰。戴之所以热心与美国人合作，恐怕由于他的野心，想借美国人之手打入军界，能拥兵自重。美国人对戴笠的兴趣是由于想通过控制军统，进一步控制国民政府。

    戴笠很想在军统内部成立一个日电破译机构。他特意从美国聘请来日电破译顾问亚德利——美国畅销书《美国黑室》的作者。此人在第一次世界大战中，曾为美国陆军部破译了上万份外国电报。战后，美国国务院和陆军部为他提供了10万美元的经费，让他创立一个专门破译日本密电码和密表体制的秘密机构——“美国黑室”。在他的协助下，军统局有了自己的黑室——军事委员会技术研究室。不久，亚德利也回国了，戴笠亲自领导这个机构为战争服务。