休斯顿火箭队宣布后卫弗朗西斯执行他现有合同的球员选项，选择留守火箭队，这就意味着弗朗西斯将继续助阵姚明为火箭队开创大场面。弗朗西斯在1999年的选秀大会上以榜眼秀的身份被灰熊队选中，但是因为感到在灰熊队没有前途所以拒绝前往，随后被交易到了火箭队。

　　下个赛季将是弗朗西斯进入NBA的第十个赛季，在1999年代表火箭队的处子赛季他就展现出了全面的才能，当时他就场均得到了18.5分5.3个篮板和6.6次助攻成为了火箭队不可或缺的新势力，随后得到重用的弗朗西斯在火箭队的作用也越来越大，他的数据也开始攀升。在他进入联盟的第四年他亲手将姚明带到了休斯顿，在与姚明并肩作战的两个赛季中弗朗西斯对姚明的照顾有如对待自己的兄弟，他甚至不惜牺牲自己的数据提高姚明的作用。

　　虽然在季后赛中没能取得成功的火箭队随后将他交易到魔术换来了麦迪，但是弗朗西斯在辗转魔术和尼克斯后仍然不忘与姚明的兄弟情意，随后他在上个赛季选择回到了休斯顿，饱受伤病困扰的弗朗西斯在上个赛季仅仅出场10场比赛，场均得到5.5分2.3个篮板和3个助攻，进行手术后的弗朗西斯仍然不忘带伤助阵火箭队的训练和比赛，由此可见弗朗西斯对火箭队的感情。